Чаще всего такая ошибка возникает в тот момент времени, когда количество запущенных Вашими скриптами процессов превышает 30 штук - система защиты сервера от перегруза не позволяет этого сделать и выдается указанная ошибка. Спустя некоторое время, когда процессы завершаются, работа сайта возвращается в обычное состояние.
Ознакомьтесь, пожалуйста, с правилами хостинга на ATLEX.Ru, пройдя по ссылке в части пункта: Использование предоставляемых ресурсов
Что необходимо предпринять в данном случае?
Вам необходимо оптимизировать работу скриптов и привести их в соответствие с правилами хостинга.
Для более подробного изучения поведения скриптов рекомендуем Вам установить в скриптах семафоры, которые будут выводить или записывать в файл данные о том, что происходит при работе скриптов, какие запросы исполняются и почему на выполнение запросов тратится такое большое количество системных ресурсов.
Ещё возможен вариант, что это ошибка в скриптах, т.е неверное использование путей относительно open_basedir. На наших серверах open_basedir = /home/USERNAME.